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臺灣氣候濕熱,空調系統中冷卻水塔是常見基本設施,又頂樓常有蓄水池,另供水管線曲折、老舊或久未使用,易有沉澱物和形成生物膜,是退伍軍人菌生長的原因。控制水中的退伍軍人菌,改變其繁殖所需之條件,為目前最主要的防治概念,臺南市政府衛生局建議業者、大樓管理者或民眾可參考疾病管制署「退伍軍人菌控制建議作業指引」所列之各類高風險環境內容及方式(加熱、加氯、銅銀離子、臭氧或紫外線消毒法),定期執行清洗及消毒工作,降低感染風險。另建議高危險群者減少使用SPA、水療按摩等沖淋設備,或靠近可能產生水霧之設施。