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日喀則位於雅魯藏布江與年楚河交會的肥沃河谷地帶，雖然日喀則建城的歷史只有500多年，但早在8世紀中，印度高僧蓮花生大師在途經此地時，看見這裡有宛如八瓣蓮花的地形，與由甘泉年楚河灌溉的肥沃田地，就預言此處將來一定是繼雪域中心拉薩後的第二政教中心。公仔箱論壇: { _: f/ o v" S" S: p; _
吐蕃王朝當政時期，將日喀則化為後藏，並在此設定葉茹和茹拉部，13世紀時，薩迦政權獲得元朝支持而崛起，日喀則一地設籍隸屬夏魯萬戶。到了14世紀初，大司徒絳曲堅贊戰勝薩迦王朝建立帕竹王朝，下設13個大宗，日喀則因是最後統一的一宗而命名為「桑珠孜」（藏語意如願以償），從此定名為「谿卡桑珠孜」，簡稱「谿卡孜」，也就是日喀則的藏語原名。
17世紀五世達賴喇嘛阿旺嘉措即位，他密召蒙古和碩特部固始汗率兵攻藏取得政權，並與四世班禪羅桑確吉堅贊分管拉薩與日喀則的政治宗教，從此日喀則成為西藏第二大城、後藏地區首府，與歷世班禪的駐錫地。